Michael Mayer-Freyholdt war Vorstudent bei Ulrike Dierick und Uwe-Martin Haiberg, bei welchem er auch sein Vollstudium begann. 1988 bis 1992 studierte er bei Uwe-Martin Haiberg an der Musikhochschule Lübeck, drei Semester bei Donald Weilerstein am Cleveland Institute of Music in Ohio/USA, sowie von 1994 bis 1996 bei Thomas Brandis an der Hochschule der Künste Berlin, bei welchem er das Konzertexamen ablegte.
In den Jahren 1989 bis 1992 wurde das Quartett von Michael Mayer-Freyholdt von Walther Levin betreut. Bundespreisträger bei "Jugend musiziert". 1983-1988 Mitglied im Bundesjugendorchester, ab 1986 als Konzertmeister.
Aushilfstätigkeiten während des Studiums beim NDR Sinfonieorchester Hamburg, sowie den Berliner Philharmonikern. Dozententätigkeit beim Bayerischen Landesjugendorchester (BLJO).
Mitglied des SERENUS Streichquartetts. Mit diesem Ensemble zahlreiche Konzerte und Rundfunkmitschnitte.
Seit 1996 Mitglied des SWR Sinfonieorchesters Baden-Baden und Freiburg, seit 2016 Mitglied des SWR Symphonieorchesters.